Los fondos de su colección se dividen en dos secciones: arqueología, con un recorrido por los yacimientos de la provincia desde el paleolítico hasta la etapa hispanomusulmana, destacando el conjunto encontrado en Cerrillo Blanco de Porcuna. Y la sección de bellas artes con una selección de grabado contemporáneo con los Caprichos de Goya y obras de Miquel Barceló.